超进化（日文︰メガシンカ，英文︰Mega
Evolution）是一种首次出现在第六世代，只发生在对战过程中的暂时性进化。然而并非所有的神奇宝贝都能超进化，这种进化目前仅出现在特定的神奇宝贝身上。
除了烈空坐，要进行超进化，必须在对战之前，由该神奇宝贝携带相对应的超进化石。战斗时，主角以食指和中指触碰另一手手腕上超进化环中的进化钥石，和神奇宝贝身上所携带的超进化石产生共鸣，使神奇宝贝在该回合对战双方使用绝招之前发生超进化。但并非所有人的进化钥石都放置于超进化环上的。
条件方面，在每场对战中，主角的队伍只能有一只神奇宝贝发生超进化，但队伍里可以存在多只携带超进化石的神奇宝贝，在对战未结束之前，超级神奇宝贝无法变回原来的样子，就算交换也一样，且即使该超级神奇宝贝濒死，其他神奇宝贝也无法进行超进化，复活后也只能恢复一般状态，无法再次进行超进化。对战结束后，超进化的神奇宝贝将会恢复原样。
超进化后的神奇宝贝，种族值、属性、特性都可能会有所改变
首先用鼠标的右键点击口袋精灵，然后点击右键就可以查看到进化目录。
经过无数次的进化，人类终于达到了超级进化的境界。人们拥有了超人类的能力，可以自由地掌控自身的基因，改变自己的身体和能力，甚至可以掌控天地之力。但与此同时，人类也失去了人性，变得冷酷无情，不再知道仁爱和同情。人类成为了绝对的主宰，却失去了灵魂和情感，最终走向了自我毁灭的结局。
结局超级进化，这个游戏的话结局是啊，男主把所有的生物都进行了个超级进化，然后打败了反派，自己就是在那个世界生活的生活下去了，一直到去世。